在机动车交通事故中，如发生涉及非医保药物的赔偿问题，保险公司可能并不会对其进行全额赔付。这是因为保险公司的理赔责任通常被划分为多个部分，如针对人身伤亡和残疾程度设立的死亡伤残赔偿限额，以及根据治疗实际开支鉴定出的医疗费用赔偿限额，此外还有应对财产损失情况设立的财产损失赔偿限额等等。而当事故当事方与保险公司之间依法签订了相关协议，明确规定对于超出医疗费用赔偿限额的费用不予赔偿时，这种做法是完全符合法律规定的。

《机动车交通事故责任强制保险条例》
第二十二条
有下列情形之一的，保险公司在机动车交通事故责任强制保险责任限额范围内垫付抢救费用，并有权向致害人追偿：
（一）驾驶人未取得驾驶资格或者醉酒的；
（二）被保险机动车被盗抢期间肇事的；
（三）被保险人故意制造道路交通事故的。
有前款所列情形之一，发生道路交通事故的，造成受害人的财产损失，保险公司不承担赔偿责任。
第二十三条
机动车交通事故责任强制保险在全国范围内实行统一的责任限额。责任限额分为死亡伤残赔偿限额、医疗费用赔偿限额、财产损失赔偿限额以及被保险人在道路交通事故中无责任的赔偿限额。