通常来讲，要是法律有规定或者当事人在合同里约定了由被告来承担鉴定费用，那这第三方的鉴定费用就该由被告来出。
就好比在民事诉讼里，当必须通过鉴定才能弄清楚案件的真实情况时，如果鉴定的事情跟被告的行为或者责任有关系，并且相关的法律或者合同也有这样的约定，那被告就得承担鉴定费用。
不过，如果法律没有明确地规定，也没有当事人约定由被告来承担，一般情况下就是由提出鉴定申请的那一方先把钱垫上，等最后根据败诉方承担的原则，由败诉的那一方来承担鉴定费用。
到底是不是由被告承担，得具体看每个案件的法律规定以及实际的情况到底是怎样的，可不能一概而论，得根据实际情况来准确判断。