公司签的协议一般盖合同专用章。合同盖章的时候优先考虑加盖公章。原因在于公章在所有印章中具有最高效力，是公司对外的权力象征，代表公司的意志，凡是以公司名义签署的文件都可以盖公章。还有一个原因就是公章刻制需要向公安机关办理印鉴备案。合同盖章后最好再签上名字。

《中华人民共和国民法典》第四百九十条
当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。