倘若在女性处于孕期阶段时施行离婚程序，那么若已生育的子女年纪尚不满两周岁，通常情况下会跟随母亲居住。
这个决策的依据在于，孩子在这段时间内对于母亲具有极强的依赖情感，母亲的陪伴可以更好地促进他们的身心健康和全面发展。
然而，当出现特殊情况，例如母亲存在如下任一问题时，子女则可能需要跟随父亲生活：
患有某种长期且难以治愈的传染病或者其他严重疾病，使得子女与她共同生活会受到影响；
母亲具备抚养能力却未尽到抚养责任，而父亲提出了子女需与其共同生活的请求；
由于其他特殊原因，例如子女确实无法适应母亲的生活环境等。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条
父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。
离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。
离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。