在双方同意通过协议离婚的情况下，对于子女的抚养权同样可根据实际情况进行合理的变更处理。
具体而言，关于如何进行此类变更，主要有两种途径供选择:
首先，由父母双方当事人协商并达成一致意见进行变更;
其次，在满足以下几种特定条件之一的情况下，任何一位父母均有权提请变更:
一是与孩子共同生活的一方由于患有严重的疾病或残疾导致自我能力不足以保护和照看孩子，或是虽具备抚养能力却故意拒绝履行相应职责，甚至对孩子实施暴力行为，以及与其共同生活的环境对于孩子的身心发育产生了不良影响;
二是从孩子利益角度考虑，当孩子年满8岁之时，出于个人意愿希望跟随另一方生活，并且该方具备足够的经济和教育资源来承担起抚养责任;
三是鉴于其他完全合法有效的理由，为保障青少年权益所需的抚养权变更申请。

《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民法典〉婚姻家庭编的解释（一）》第五十六条
具有下列情形之一，父母一方要求变更子女抚养关系的，人民法院应予支持：
（一）与子女共同生活的一方因患严重疾病或者因伤残无力继续抚养子女；
（二）与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或者其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响；
（三）已满八周岁的子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力；
（四）有其他正当理由需要变更。