非婚生子女抚养权协议能变更。不论是对于非婚生子女的抚养权归属问题还是抚养费的支付问题，即使达成了协议日后也是可以变更的。孩子的父母双方可以自行协商变更，也可以起诉至法院变更。
存在下列情形的可以变更孩子的抚养权：
1、与子女共同生活的一方因患严重疾病或因伤残无力继续抚养子女的；
2、与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响的；
3、八周岁以上未成年子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力的；
4、有其他正当理由需要变更的。
存在下列情况的可以变更子女的抚养费：
1.原定数额难以维持子女生活所需；子女升学、实际所需抚养费用超过原定数额以外；子女身患疾病，抚养一方无力支付全部医疗费用；有给付义务的一方经济收入显著增加的，可以要求增加抚养费。
2.给付一方，由于长期疾病或者丧失劳动能力，经济相当困难，无力按原数额给付，而抚养子女一方又能负担子女的大部分抚养费，那么可请求减少给付。

《民法典》第一千零七十一条
非婚生子女享有与婚生子女同等的权利，任何组织或者个人不得加以危害和歧视。
不直接抚养非婚生子女的生父或者生母，应当负担未成年子女或者不能独立生活的成年子女的抚养费。