生理缺陷婚姻无效证据是相关的医学诊断证明书。
我国法律规定，只有以下婚姻属于无效婚姻：
1.重婚；
2.有禁止结婚的亲属关系；
3.未到法定婚龄。
4.一方有生理缺陷的婚姻并不是无效婚姻。
无效的或者被撤销的婚姻自始没有法律约束力，当事人不具有夫妻的权利和义务。

《中华人民共和国民法典》第一千零五十一条
有下列情形之一的，婚姻无效：
（一）重婚；
（二）有禁止结婚的亲属关系；
（三）未到法定婚龄。