在分居长达两年之久的情况下，若决定前往民政局办理离婚证书手续，具体可分为如下两种途径进行。
若双方当事人在深思熟虑之后，能够就关于离婚的各项事宜达成共识，那么他们便可选择通过协议离婚的方式来处理这个问题。
在这个过程中，他们需提前做好充分的准备工作，包括持各自的身份证件、户口本、结婚证书以及详细的离婚协议等资料，然后共同前往当地的婚姻登记机构提出离婚登记的申请。
在经过为期30天的离婚冷静期之后，双方当事人必须亲自再次来到婚姻登记机构，并提交申请领取离婚证书。
倘若双方无法就离婚事宜达成一致意见，那么他们便只能选择向法院提起诉讼离婚的程序。
在此过程中，他们需要准备好起诉书、身份证件、结婚证书以及能够证明已经分居两年且夫妻感情确已破裂的相关证据等文件资料。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。