解除婚姻关系的分居协议在特定情况之下具有合法性的法律效应。
此种合同文书能够详尽规定夫妻双方在尚未离婚阶段各自所应承担的责任和享有的权益，包括财产的清晰界定以及未成年子女的抚养权问题等等。
若该份协议中包含的条款均为双方当事人的真实意愿表达，且未触犯任何法律法规的强制性规定，亦无悖于社会公共道德规范，则在双方签署并确认后，便可对彼此产生法律上的约束力。
然而，当涉及到第三方利益时，其法律效力可能会受到一定程度的限制。

《中华人民共和国民法典》第一百四十三条
具备下列条件的民事法律行为有效：
（一）行为人具有相应的民事行为能力；
（二）意思表示真实；
（三）不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗。