若当事人因分居长达两年而申请离婚，一般需要准备以下资料文件：
包括本人的户口簿、身份证、结婚证等有效凭证以及详细撰写的离婚起诉状。
此外，为了证实的确已经分居达到了两年之久，还需提供相关的证据资料，例如租赁合约、社区委员会开具的证明等等。
在办理离婚手续的过程中，如若双方能够达成共识并自愿离婚，则可共同前往婚姻登记机关进行申请，待经过为期约30日的冷静思考期之后，双方再次联手提出申请即可顺利获得离婚证书。
然而，若双方无法就离婚事宜达成共识时，其中任一方均有权通过向法院递交离婚诉求来启动离婚程序。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。