通过协议方式解除夫妻关系的流程主要包括以下几个步骤：
首先，当事人应当就离婚意向、未成年子女抚养、家庭财产分割以及债务承担等议题达成共识，并以书面形式签署离婚协议。
紧接着，夫妻二人应共同赴婚姻登记机关办理离婚申请手续。
然后，婚姻登记机关将对立案申请的各项文件进行一一核实，自申请日起满30天内，若有任意一方表示不愿离婚，可向婚姻登记机关撤销离婚登记申请。
在这之后的第31至60天之间，双方必须再次亲自前往婚姻登记机关申请颁发离婚证书；
如未能按时提出申请，则视为自动放弃离婚登记申请。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。