在我国的法律体系中，分居三个月并不能自动触发离婚程序。
离婚的法定途径主要分为协议离婚以及诉讼离婚两大类别。
协议离婚则需夫妻双方就离婚事宜自愿达成共识，且须亲自前往办理离婚手续的婚姻登记机构提出申请。
而在诉讼离婚过程中，仅仅是分居三个月的情况往往并不满足法定的离婚理由。
然而，若因为情感不合而分居持续超过两年，并且在经过一系列的调解尝试之后仍未得到有效解决，那么法院便应根据实际情况作出准许离婚的决定。
根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当夫妻中的一方提出离婚请求时，可以先通过相关组织进行调解，如未能达成一致意见，可直接向当地人民法院提起离婚诉讼。
人民法院在审理离婚案件时，必须先行进行调解工作；
若发现夫妻之间的感情确实已经破裂，无法挽回，调解无效的情况下，应当依法准予离婚。
以下列举了几种可能导致夫妻感情破裂的情形：（1）重婚或与他人长期同居；
（2）对家庭成员实施家庭暴力或虐待、遗弃行为；
（3）存在赌博、吸毒等不良嗜好且屡教不改；
（4）因感情不合而分居时间长达两年以上；
（5）其他可能导致夫妻感情破裂的因素。
此外，若一方被宣告失踪，另一方在此基础上提起离婚诉讼，法院也应予以受理并作出相应裁决。
若经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，其中一方再次提起离婚诉讼，法院同样应予以受理并作出是否准予离婚的决定。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十九条
夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。