法院判决离婚与协议离婚的区别为：
1.条件不同。判决离婚是夫妻关系破裂，调解无效而离婚；协议离婚是双方自愿离婚。
2.办理部门不同。协议离婚去民政部门，诉讼离婚去法院起诉。
3.概念不同。诉讼离婚是指夫妻双方就是否离婚或者财产分割等问题无法达成一致意见，向人民法院起诉，人民法院经审理后通过调解或者判决解除婚姻关系的离婚制度，而协议离婚是因双方约定而解除婚姻关系的离婚方式。

《中华人民共和国民法典》第一千零七十六条
夫妻双方自愿离婚的，应当签订书面离婚协议，并亲自到婚姻登记机关申请离婚登记。
离婚协议应当载明双方自愿离婚的意思表示和对子女抚养、财产以及债务处理等事项协商一致的意见。