处理商品房预售合同争议的程序如下：若双方在合同中有明确约定，应遵循契约精神按约执行；如无具体约定，则需参照合同中其他相关条文判断，协议优先适用；如果双方协商无果，可考虑寻求基层社会组织的协助进行调解；倘若调解仍无法达成共识，那便需要将相关案件提交至当地法院进行裁决；在此过程中，若当事人签署了有效的仲裁协议或含有仲裁条款的合同，则有权提出申请，由相应的仲裁机构介入并开展仲裁工作。最后，当事人亦可选择直接提起诉讼或仲裁程序以维护自身权益。

《民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：（一）当事人的姓名或者名称和住所；（二）标的；（三）数量；（四）质量；（五）价款或者报酬；（六）履行期限、地点和方式；（七）违约责任；（八）解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。《民事诉讼法》第一百二十二条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。