针对小产权房屋所产生的纠纷问题，我们可以采取以下几种方式来妥善处理：首先，采取和解的方式来解决争议。即纠纷各方当事人通过协商和妥协达成共识，自行解决纷争；其次，如果当事人无法自行解决纠纷，也可以寻求第三方机构的介入，通过调解的方式来化解矛盾；再者，若双方已经签署了仲裁协议，则应根据协议中的具体规定，向相关仲裁机构提出仲裁申请；最后，在仲裁程序无法解决问题的情况下，当事人还可以选择向有管辖权的法院提起诉讼。

《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。