若与出售小产权住房的业主发生纷争，应当先尝试通过协商予以化解。关于此种房屋的属性问题，其一在于在农村地区所建立的“宅基地”之上构建的住房，属于村级集体经济组织所有，从严格法律意义上讲，外来居民并无资格进行购买。另一类则为利用农村集体所有制企业的土地或者违规侵占农用耕地而兴建的住宅，倘若购买之“小产权房”属于此类性质，那么由此引发的争议便需直接与开发方进行协商以寻求妥善解决方案。
然而，若开发商已获得相关组织部门的审批许可，那么其所签订的购房合同亦将被视为合法有效。

《中华人民共和国土地管理法》第一百三十六条小产权房不能向非本集体成员的第三人转让或出售，即购买后不能合法转让过户。其同时对房屋的保值和升值也有一定影响。