针对预售商品住宅发生的纠纷处理方法包括以下几个方面：
首先，如果双方在购房协议中已经明确约定了解决方案，应当按照该约定执行；
其次，若未在购房协议之中作出相关规定，那么应以双方协商达成的共识为准；
再次，若双方无法通过协商达成一致意见，可选择向相关调解机构提出申诉；
最后，若调解未能取得预期效果，则可依法向法院提起诉讼。
此外，若当事人在购房过程中有签订仲裁协议或者仲裁条款的情况，也可选择向仲裁机构提交仲裁申请。
同时，行为人亦有权不经调解直接提起诉讼或申请仲裁。除此之外，法律还规定了其他可能适用的解决途径。

《民事诉讼法》第一百二十五条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。