处理商品房预售合同纠纷的方式主要包括以下几种：
1.在双方签署的合同中对争议解决方式有明确约定的，应当按照该约定来解决争议。
2.如果在合同中并未对争议解决方式做出约定，则应当遵循“协议优先”原则，由双方通过平等、自愿协商达成共识。
3.若经双方协商仍无法就争议达成一致意见的，可以请求当地基层组织介入调处。
4.若经过基层组织调解后仍然未能解决争议的，当事人有权向人民法院提起诉讼。
5.对于已经签订了仲裁协议或者在合同中有仲裁条款的情况，当事人还可以选择向相应的仲裁机构提出仲裁申请。
6.此外，当事人亦可直接选择采取诉讼或仲裁的方式来解决争议。

《民法典》第四百七十条合同的内容由当事人约定，一般包括下列条款：（一）当事人的姓名或者名称和住所；（二）标的；（三）数量；（四）质量；（五）价款或者报酬；（六）履行期限、地点和方式；（七）违约责任；（八）解决争议的方法。当事人可以参照各类合同的示范文本订立合同。《民事诉讼法》第一百二十二条当事人起诉到人民法院的民事纠纷，适宜调解的，先行调解，但当事人拒绝调解的除外。《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。