对于门店转让所引发的纠纷，可采取以下几种途径进行妥善处理：首先是双方当事人通过友好协商达成共识并解决争议；其次，如若未能达成和解，可以选择向相应的调解机构提出调解请求，由其协助促进问题的化解；第三种方法是依据双方事先签订的仲裁协议，各自依法向具有管辖权的仲裁机构提交仲裁申请，由仲裁机构进行公正裁决；最后，如果以上途径均无法解决问题，则可以考虑向法院提起诉讼，并按照相关法律程序提交起诉状及相关证据材料。

《中华人民共和国民法典》第一百八十八条向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十三条起诉应当向人民法院递交起诉状，并按照被告人数提出副本。书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民法院记入笔录，并告知对方当事人。《中华人民共和国仲裁法》第二条平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。