关于小产权房交易纠纷问题所在，主要体现在以下几个方面：首先，与其他类型房产相比，小产权房仅拥有使用权而非所有权；其次，因为缺乏国家发放的土地使用证以及预售许可证的支持，小产权房在法律上并不具备保护体制；再者，对于需要拆除重建的小产权房来说，困难重重，难以获取全额的拆迁补偿款；最后，由于小产权房不具备房屋所有权及转让、处分、收益等相关权益，因此无法作为抵押品进行流转。

《城市房地产管理法》第六十条
国家实行土地使用权和房屋所有权登记发证制度。
《民法典》第二百零九条
不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
第二百一十五条
当事人之间订立有关设立、变更、转让和消灭不动产物权的合同，除法律另有规定或者当事人另有约定外，自合同成立时生效；未办理物权登记的，不影响合同效力。