公司回购股份后的处理方式主要有以下几种：
股票注销：公司将回购的股份从总股本中扣除，予以注销。注销后的股票不再具有表决权、分配股利等权利，也不再参与公司的资产清算。这一做法通常用于减少公司的总股本，提高每股收益和股价。
作为库存股保留：公司可以将回购的股份留存，作为库存股。库存股不参与公司的日常经营和股东权益的分配，但在特定的情况下，如公司需要发行新股、可转债或是进行员工股权激励时，库存股可以被重新激活使用。
股权激励计划：公司将回购的股份用于实施员工股权激励计划，如股票期权或限制性股票等。这样做的目的是激励员工，提高其工作效率和公司的整体绩效。
转增资本：公司可以将回购的股份转为资本，增加公司的注册资本。这通常在公司的资本结构调整时使用。
资产重组：公司回购股份后，可能用于资产重组，如与他人合并、分立或是转让等。
维护公司价值及股东权益：在某些情况下，公司回购股份可能是为了维护公司价值及股东权益，避免因股价过低或市场动荡导致股东利益受损。
法律依据：《中华人民共和国公司法》规定，公司在特定情况下可以回购股份，如减少注册资本、与持有本公司股份的其他公司合并、将股份用于员工持股计划或者股权激励、股东因对股东大会作出的公司合并、分立决议持异议，要求公司收购其股份等。
需要注意的是，公司回购股份必须遵守相关法律法规和公司章程的规定，经过股东大会或董事会的决议，并在规定的时间内完成。此外，回购股份的具体处理方式应根据公司的实际情况和股东大会的决议来确定。

《中华人民共和国公司法》第一百四十三条上市公司收购本公司股份后，属于下列情形之一的，应当依法办理变更登记：
（一）作为库存股保留；
（二）用于公司增发或者送股；
（三）用于转换为公司其他类别股份；
（四）上市公司为维护公司价值及股东权益所必需。