董事长和大股东根据公司章程界定有不同的权限。
大股东是股东大会组成部分，根据股权占比享有投票权，而董事长是董事会成员，在董事会享有投票权，董事会一般是常设的公司治理层，对公司管理层相关业务进行监督，而大股东只能通过股大会行使权力。
股份公司有事情要表决就由股东大会投票,投股权比例计票,占多数通过,不是谁一人说了算的,当然一个持股超过百分之50就一人说了算.平常日常经营事项由总经理(也就是法人)说了算,股东大会公司章程规定了总经理的权限的.在他的权限内他说了算.股东如果对总经理的经营管理不满,可以召集召开股东大会罢免总经理。

《中华人民共和国公司法》第二十一条，公司的控股股东、实际控制人、董事、监事、高级管理人员不得利用其关联关系损害公司利益。违反前款规定，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。