公司间股权转让程序有以下这些：
1、首先，需要审查公司章程对股东内部的股权转让有没有特殊规定。
如果有特殊规定，且不违反法律的效力性强制性规定的，应按照公司章程的规定办理。
2、如果章程对股东内部的股权转让没有特殊规定，则按照《公司法》第七十一条，有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权的规定，公司股东之间的股权转让没有任何限制。
3、转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。
对公司章程的该项修改不需再由股东会表决。

《公司法》第七十一条
股权转让
有限责任公司的股东之间可以相互转让其全部或者部分股权。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。其他股东半数以上不同意转让的，不同意的股东应当购买该转让的股权；
不购买的，视为同意转让。经股东同意转让的股权，在同等条件下，其他股东有优先购买权。两个以上股东主张行使优先购买权的，协商确定各自的购买比例；
协商不成的，按照转让时各自的出资比例行使优先购买权。公司章程对股权转让另有规定的，从其规定。