首要的是，两者适用的法律法规有所出入。
针对合伙企业的份额划分，我们应当参考《中华人民共和国合伙企业法》中的相关条例进行操作；
然而对于股权问题，我们应该依据《中华人民共和国公司法》中的具体规则来实施。
其次，两者在权利性质方面亦存在显著区别。
相较之下，合伙企业份额所反映出的是各合伙人之间的契约关系以及他们在共同经营过程中所承担的权利与义务；
而股权则代表了股东对公司的所有权及决策权。
此外，在转让限制上，二者也存在明显差异。
通常情况下，合伙企业份额的转让需得到全体合伙人的一致同意方可实现；
相比之下，股权的转让在满足《中华人民共和国公司法》中规定的各项条件后，其转让行为便可相对自由地进行。

《中华人民共和国合伙企业法》第二十二条
除合伙协议另有约定外，合伙人向合伙人以外的人转让其在合伙企业中的全部或者部分财产份额时，须经其他合伙人一致同意。合伙人之间转让在合伙企业中的全部或者部分财产份额时，应当通知其他合伙人。