对于合伙人选择退出合作关系是否需要退还其本金，这应根据各方签署的合伙协议中的具体约定进行处理。如果协议明确规定了合伙人可以在特定条件下要求退还本金，那么根据该协议相关条款予以执行即可。
然而，若欲从合伙企业中撤资并收回本金，则需符合相关法律法规的要求。例如，必须经过所有合伙人共同协商达成一致意见；如因退伙行为导致其他合伙人遭受经济损失，则应承担相应的赔偿责任；同时，在决定退伙之前，应对合伙企业所负之债务承担连带清偿责任等。只有在满足上述各项条件后，方可依法取回本金。
此外，若得到其他合伙人的同意，也可选择退伙。在此情况下，如有书面约定则按照约定执行，若无书面约定，则按照合伙资金在退伙时的实际价值返还本金。

《中华人民共和国合伙企业法》第十七条
合伙人应当按照合伙协议约定的出资方式、数额和缴付期限，履行出资义务。以非货币财产出资的，依照法律、行政法规的规定，需要办理财产权转移手续的，应当依法办理。