通常来讲，保险公司是会对运营车的停运损失费进行赔偿的。
从《中华人民共和国民法典》的角度来看，一旦因为交通事故使得营运车辆无法正常运营，侵权方就有责任赔偿受害人因为车辆停运而遭受的损失。
在保险范畴内，交强险以及商业三者险的范围内，保险公司通常是需要承担赔偿责任的。
然而，到底是否会给予赔偿以及赔偿的具体金额，这得依据保险合同的约定来进行判定。
假如保险合同中清晰地写明了会赔偿停运损失费，并且也满足赔偿的条件，那么保险公司就应当按照约定进行赔偿。
可要是保险合同没有相关约定，或者约定得不够明确，这时候双方就很可能会引发争议，这种情况下就需要通过诉讼等方式来妥善解决。
总之，只要是在符合保险合同约定的前提下，一般来说保险公司都应该对运营车的停运损失费进行赔偿。
这既保障了受害人的合法权益，也体现了保险合同的法律效力和作用。

案情回顾:

小朱驾驶车辆与小李驾驶的运营车发生交通事故，导致小李车辆受损无法正常运营。小李要求小朱所投保的保险公司赔偿停运损失费，保险公司以保险合同未明确约定为由拒绝赔偿，双方产生争议。

案情分析:

1、根据《中华人民共和国民法典》，因交通事故使营运车辆无法正常运营，侵权方应赔偿受害人停运损失。小朱作为侵权方，理论上应担此责任。
2、保险公司是否赔偿需依据保险合同约定。若合同明确约定赔偿且符合条件，应赔偿；若未约定或约定不明引发争议，可能需通过诉讼解决。