若协议签订后产生异议，可按以下步骤处理：
1.查看协议条款：首先仔细查看协议中是否有关于异议处理的相关约定。
这是解决问题的重要依据，需认真研读协议的各项细则。
2.按约定处理：若协议中有约定，那就严格按照约定的程序和方式来操作。
例如，可能要求在特定的期限内，以书面形式提出异议，详细说明异议的具体内容和理由等，务必确保符合约定的要求。
3.协商解决：若协议中未对异议处理作出约定，可尝试与对方进行协商。
明确清晰地阐述自己异议的具体内容和诉求，秉持友好、理性的态度，争取通过协商达成双方都能接受的一致意见。
4.仲裁或诉讼：若协商无法解决问题，可根据实际情况选择仲裁或诉讼途径。
仲裁需看协议是否约定仲裁条款及仲裁机构，符合约定可申请仲裁；未约定或约定不明，则向有管辖权的法院起诉。
在整个处理过程中，要注意妥善保留相关证据，如协议文本、往来函件等，以此维护自身合法权益。

案情回顾:

小朱与小李签订协议后，小朱对协议内容产生异议。小朱认为应按自己理解处理，小李则主张按协议相关约定处理，双方就异议处理方式产生争议。

案情分析:

1、小朱和小李应先查看协议条款，看是否有关于异议处理的相关约定，这是解决争议的重要依据，需仔细研读协议细则。
2、若协议中有约定，双方应严格按约定程序和方式操作，如在特定期限内书面提出异议等。
3、若协议未作约定，双方可尝试协商解决，小朱应清晰阐述异议内容和诉求，友好理性协商。
4、若协商不成，根据实际情况选择仲裁或诉讼。若有仲裁条款及机构约定可仲裁，否则向有管辖权法院起诉，且要保留相关证据。