针对协议违规问题的处理方式，主要取决于其协议种类、实际违规行为以及由此产生的不良后果等诸多复杂的因素。
在处理该类事务时，首先必须明确协议的类别，例如所涉协议为民事合约、劳资合同时，抑或是其他特定类型的协议。
若是在民事合约中出现了违规现象，一般可依据合约中所载明的违约条款，要求违约方承担起相应的违约责任，譬如请求其继续履行合约义务、实行适当的补救措施、支付相应的损害赔偿金、或者交付违约金等等。
然而，受害方在面对这样的状况之时，必须秉持严谨细致的态度，及时收集并保存相关的证据材料，以便证实时段违约事实的真实性与严重程度。
至于在劳动合同领域出现的违规现象，往往可能涉嫌到劳动仲裁及诉讼程序，此时便需要劳动监察部门或司法机关依据相关的法律法规以及具体案情，做出公正合理的裁决。
总而言之，在处理协议违规问题时，我们必须全面考虑各类因素，依据具体的法律规定以及确凿的证据，来制定出最为恰当的处理方案。