在借款合同中，当事人有权就违约金的数额或损失赔偿额的计算方式进行明确约定。
若合同中有对违约金的详细规定，则应严格依照合同执行。
然而，若约定的违约金低于实际所遭受的损失，当事人可向人民法院或仲裁机构提出申请，要求提高违约金的数额；
反之，若约定的违约金过高，超过了实际损失，当事人亦可请求适当降低违约金。
若借款合同中并未明确规定违约金或损失赔偿额的计算方式，抑或是约定模糊不清，那么人民法院或仲裁机构将依据案件的具体情况，参考相关的法律法规及司法解释，同时兼顾公平原则与诚实信用原则，合理地确定违约金的数额。
在实践操作过程中，违约金的计算往往会综合考虑到借款合同的各项条款、借款金额、借款期限以及违约行为等多方面因素。
若借款合同中有针对违约金的特殊约定，则应严格按照该约定执行；
如无特殊约定，则可参照银行同期贷款利率、市场利率等因素来确定违约金的数额。
总而言之，借款合同违约金的计算应以合同约定为基础，若合同约定不明或缺失，则可参照相关法律法规及司法解释，结合实际情况予以确定。

《中华人民共和国民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。
约定的违约金低于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以增加；约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
当事人就迟延履行约定违约金的，违约方支付违约金后，还应当履行债务。