并非所有超出三年期限的借款纠纷都将无法立案。
此类纠纷的法定诉讼时效一般设定为三年，然而，诉讼时效的起算点是从债权人意识到或者应该意识到自身权益遭到侵害，并且债务人知晓这一事实的那一日开始计算。
在特定状况下，诸如权利人提交申请等情形，人民法院亦可依职权决定适当延长诉讼时效期。
即便已经超出三年的诉讼时效，债权人仍有权依法向法院提出诉讼请求，法院应当依照程序予以受理。
当然，若债务人届时提出诉讼时效抗辩，并且经查证确实没有发现存在诉讼时效中止、中断或延长的事由，那么法院将会作出不利于原告的裁决。
但是，倘若债务人为提及诉讼时效抗辩，法院并不会自动援引诉讼时效的相关规定来做出裁判。

《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。