当夫妻共同债务中的一方已经还清全部款项时，在离婚时可以通过以下途径来维护自身权益。
其一，务必妥善留存已还款的相关证据，像转账记录这类，这是后续维权的关键依据。
在离婚协议里，必须清晰地注明该债务已由一方全部清偿完毕，这样能有效避免后续可能出现的各种纠纷。
其二，如果在离婚之后，对方依然坚持声称该债务仍为共同债务，那么已还款的一方就可以凭借之前留存的证据，理直气壮地向对方主张自己已经承担了全部的债务，不应该再承担所谓的共同债务份额。
其三，倘若双方无法通过协商达成一致意见，已还款方可以向法院提起诉讼。
在诉讼过程中，要求法院确认该债务确实已经由自己清偿完毕，对方不再享有该债务的任何权利。
法院会秉持公正的态度，依据双方所提供的证据以及相关的法律规定进行严谨的判定，从而切实维护已还款方的合法权益，确保其不会因为离婚而遭受不必要的经济损失。
案情回顾:
小朱和小丽是夫妻，存在夫妻共同债务。小朱独自还清了全部款项。离婚时，小丽未承认小朱已还清债务，小朱虽有转账记录等还款证据，但小丽仍坚持债务为共同债务。双方协商无果，小朱欲维护自己权益。
案情分析:
1、小朱留存的转账记录等还款证据很关键，可证明债务已清偿。
2、按照规定，小朱可在离婚协议注明债务已由自己清偿，避免后续纠纷，但小丽不承认。
3、双方协商不成时，小朱可向法院诉讼，法院会根据证据和法律规定判定，以维护小朱权益。