在抵押合同被认定为无效时，可能存在以下几种情况:
首先是作为主债权债务合同的基础部分无效;
其次，抵押的财产必须属于法律、行政法规明确规定禁止用于抵押的范畴;
再次，抵押协议并非签署双方的真实意愿反映，存在欺诈或其他不正当行为的可能;
最后，若签署抵押协议的当事人并未取得足够的公民权利和资格，那么这份合同也将自动失效。

《民法典》第三百八十八条
设立担保物权，应当依照本法和其他法律的规定订立担保合同。担保合同包括抵押合同、质押合同和其他具有担保功能的合同。担保合同是主债权债务合同的从合同。主债权债务合同无效的，担保合同无效，但是法律另有规定的除外。