云闪付可以交农村合作医疗。
新型农村合作医疗是指由政府组织、引导、支持，农民自愿参加，个人、集体和政府多方筹资，以大病统筹为主的农民医疗互助共济制度。其采取个人缴费、集体扶持和政府资助的方式筹集资金。
云闪付交农村合作医疗流程如下：
1、用户下载并登录云闪付；
2、在云闪付的首页中，用户找到城乡医保，输入个人身份证信息查询并缴纳；
3、缴费成功之后可通过城乡医保缴费记录查询相关信息。

《中华人民共和国社会保险法》第二条
国家建立基本养老保险、基本医疗保险、工伤保险、失业保险、生育保险等社会保险制度，保障公民在年老、疾病、工伤、失业、生育等情况下依法从国家和社会获得物质帮助的权利。