医疗事故鉴定费用的承担方式通常是这样的：首先，双方当事人会对鉴定费用进行协商来确定。
要是协商不成，就由卫生行政部门指定的机构先把钱垫付了。
具体来讲，要是医疗事故争议经过鉴定后被认定属于医疗事故，那这笔鉴定费用就由医疗机构来支付；
可要是不属于医疗事故，那鉴定费用就得由提出医疗事故处理申请的那一方来出。
另外，经鉴定确定不属于医疗事故，但是医患双方对首次医疗事故技术鉴定结论不满意的话，就可以从收到首次鉴定结论的那天起，在15天之内向医疗机构所在地的卫生行政部门提出再次进行鉴定的申请，而这次再次鉴定的费用，是由申请再次鉴定的那一方提前支付的。
总的来说，医疗事故鉴定费用的承担主体，会因为鉴定结果以及申请方的不同而有所变化。