公司名称侵权的处理有：
登记主管机关有权责令侵权人停止侵权行为，赔偿被侵权人因该侵权行为所遭受的损失，没收非法所得并处以五千元以上、五万元以下罚款。
此外，企业亦可根据侵权者的侵权行为及企业遭受的损失，适用《反不正当竞争法》，要求人民法院依法判令侵权者赔偿因此给企业造成的损失。

《企业名称登记管理规定》第二十七条
擅自使用他人已经登记注册的企业名称或者有其他侵犯他人企业名称专用权行为的，被侵权人可以向侵权人所在地登记主管机关要求处理。
登记主管机关有权责令侵权人停止侵权行为，赔偿被侵权人因该侵权行为所遭受的损失，没收非法所得并处以5000元以上、5万元以下罚款。
对侵犯他人企业名称专用权的，被侵权人也可以直接向人民法院起诉。