当起诉停运损失费却没有流水证明时，确实可能会遭遇一些困难。
在一般情况下，停运损失费应当依据实际的经济损失来进行主张，而流水证明恰好是其中非常重要的一项证据。
然而，这并不意味着就完全不能主张停运损失费了。
我们可以尝试去提供其他相关的证据，同时，与停运相关的其他费用支出凭证也能起到关键作用，像停车费，它体现了车辆在停运期间因停车而产生的费用；车辆保养费则反映了车辆在停运期间仍需进行保养维护的支出。
这些凭证可以间接地证明在停运期间所遭受的经济损失。
倘若这些证据也比较难以获取，那么我们还可以考虑寻求专业的评估机构来对停运损失进行评估。
专业评估机构会根据车辆的实际情况、停运时间等因素，出具一份专业的报告作为证据。
不过，需要注意的是，评估过程往往会比较复杂，并且需要支付一定的费用。
总之，虽然没有流水证明会加大主张停运损失费的难度，但我们仍然可以通过提供其他途径的证据，并且在必要时寻求专业评估机构的帮助，来尽力争取维护自身的合法权益。

案情回顾:

小朱的车辆因小李的责任事故导致停运，小朱起诉小李索要停运损失费，但没有流水证明。小朱提供了租车合同、停车费及车辆保养费凭证等，小李却质疑这些证据的关联性和证明力，双方就停运损失费的认定产生争议。

案情分析:

1、小朱虽无流水证明，但租车合同能明确车辆租赁情况及约定，可在一定程度上辅助证明停运损失。
2、停车费及车辆保养费凭证等能间接体现停运期间的经济损失，具有一定证明力，但可能不足以精准确定损失数额。
3、若证据仍不足，寻求专业评估机构评估虽复杂且有费用，但出具的报告可作为有力证据。