在男方服刑这种特殊情况下，两个孩子的抚养权通常会判给女方。
以下是详细的分析：
一、法院判定的考虑因素
法院在判定孩子抚养权归属时，始终将有利于子女身心健康以及保障子女合法权益作为首要出发点。
当男方处于服刑阶段，其人身自由受到极大限制，这使得他在很多方面难以履行直接抚养孩子的责任。
例如，在日常生活方面，他无法像正常状态下那样，每天按时为孩子准备饭菜、接送孩子上下学；在教育方面，他也不能参与学校组织的亲子活动，无法辅导孩子的功课，给予孩子在成长过程中所需要的陪伴和引导。
二、女方具备的优势
一般而言，只要女方的生活条件相对稳定，能够为孩子营造一个正常的生活和教育环境，那么她获得抚养权的可能性就比较大。
女方可以为孩子提供一个稳定、温馨的居住环境，让孩子有安全感。
在日常照顾上，能关注孩子的饮食起居、身体健康；在情感关怀方面，给予孩子足够的关爱，帮助孩子健康成长。
三、可能出现的特殊情况
不过，也存在一些特殊情况。
在这些情况下，法院可能会综合多方面因素，考虑让其他亲属抚养，或者制定其他合适的抚养方案，但这种情况相对来说比较少见。

案情回顾:

小朱和小丽育有两个孩子，后小朱因犯罪服刑。小丽要求获得两个孩子的抚养权，小朱虽在服刑但表示也希望争取抚养权，双方就孩子抚养权问题产生争议。

案情分析:

1、法院判定抚养权以有利于子女身心健康及保障其合法权益为出发点。小朱服刑，人身自由受限，难以履行日常照顾、教育陪伴等抚养责任。
2、若小丽生活条件稳定，能为孩子营造正常生活教育环境，她获抚养权可能性大，可提供稳定居住环境、日常照顾及情感关怀。
3、若小丽存在严重疾病、虐待孩子或经济极差且无亲属协助等特殊情况，法院会综合考虑其他抚养方案，但这种情况较少见。