在现实生活中，当双方没有领取结婚证时，他们之间就属于非婚同居关系。
这种情况下，如果有两个小孩，关于孩子的分配问题，一般会按照以下原则来处理：
1.协商优先原则：
双方可以先自行协商，心平气和地讨论两个孩子的抚养安排。
这是比较理想的解决方式，因为父母最了解自己孩子的需求。
在协商过程中，要全面考虑各种因素，当双方达成一致意见后，应当签订一份详细的抚养协议。
这份协议要明确规定双方各自的权利和义务，例如探视孩子的时间、方式，抚养费的支付标准和支付方式等，确保双方都清楚自己的责任。
2.法院判决原则：
如果双方经过多次协商都无法达成一致，那么就可以向法院提起诉讼。
法院在判决时，会始终把孩子的利益放在首位，从有利于子女身心健康、保障子女合法权益的角度出发。
同时，法院还会结合父母双方的抚养能力和抚养条件等具体情况进行综合判断。
通常情况下，法院可能会判决一方抚养一个孩子。
但要是其中一方存在不适合抚养孩子的情形，像患有严重的传染性疾病、有赌博、吸毒等不良嗜好，法院可能会判决两个孩子都由另一方抚养。
而不直接抚养孩子的一方，需要按照法律规定支付相应的抚养费。

案情回顾:

小朱和小李非婚同居并育有两个小孩，后两人分开，就孩子分配问题产生争议。小朱主张一人抚养一个，小李则希望两个孩子都由自己抚养，双方协商多次未达成一致。

案情分析:

1、按照协商优先原则，小朱和小李本应心平气和协商，考虑孩子生活习惯、学习环境等因素，达成一致后签订抚养协议明确权利义务，但两人未能协商成功。
2、鉴于协商无果，若诉至法院，法院会以孩子利益为先，综合判断双方抚养能力和条件，如经济收入、生活环境及与孩子感情等。若一方有不适宜抚养情形，可能两个孩子都判归另一方，不直接抚养方需付抚养费。