关于离婚时三个月孩子抚养权的判定，通常会遵循一定的原则，以下为你详细阐述：
一、两周岁以下原则归女方
依据相关法律规定，离婚后，不满两周岁的子女，一般以由母亲直接抚养作为原则。
对于三个月大的孩子而言，正处于哺乳期。
这个阶段的孩子，身体各方面机能尚未发育完全，对母亲的依赖程度极高。
母亲的乳汁是孩子最天然、最健康的食物来源，能为孩子提供生长发育所需的营养。
而且，母亲在长期的孕育过程中，与孩子建立了深厚的情感联系，更能敏锐地感知孩子的需求，给予孩子细致入微的照料和无微不至的关爱。
所以，从孩子的生理和心理需求出发，由母亲抚养更有利于孩子的健康成长。
二、特殊情况可归男方
不过，在某些特殊情况下，抚养权也可能会判给男方。
例如，若母亲患有久治不愈的传染性疾病，像艾滋病、梅毒等，或者患有其他严重疾病，如严重的精神疾病等，这些疾病可能会对孩子的健康造成威胁，使得子女不宜与其共同生活。
又或者母亲虽然具备抚养条件，但却不尽抚养义务，对孩子疏于照顾，而父亲明确表示要求子女随其生活，在这种情形下，若父亲请求直接抚养孩子，人民法院在综合考量后，也可能会支持父亲的请求。
总之，法院在判定抚养权归属时，会全面综合各种因素，始终将最有利于孩子成长作为出发点。

案情回顾:

小朱和小李结婚后育有一三个月大的孩子，后两人感情破裂准备离婚，就孩子抚养权产生争议。小朱主张自己抚养，小李则称小朱患有传染性疾病可能威胁孩子健康，要求自己抚养孩子。

案情分析:

1、按照法律规定，两周岁以下子女一般由母亲直接抚养。三个月大的孩子处于哺乳期，对母亲依赖高，母亲能给予细致照料，从生理和心理需求看，小朱抚养更有利。
2、若小朱确实患有久治不愈的传染性疾病等特殊情况，对孩子健康有威胁，且小李明确表示要抚养孩子，法院综合考量后，可能会支持小李的请求。