关于三周岁孩子在父母离婚时的抚养权归属问题，通常会依据以下规则来判断：
一、协商优先
父母双方首先可以进行协商，共同确定孩子抚养权的归属。
在协商过程中，双方应充分考虑孩子的利益和需求。
如果双方能够达成一致意见，并且这种安排有利于孩子的成长和发展，比如能够为孩子提供稳定的生活环境、良好的教育资源以及足够的关爱和照顾等，那么法院通常会对协商结果予以认可。
这种方式能够最大程度地减少对孩子的伤害，让孩子在熟悉的环境中健康成长。
二、综合考虑因素
若双方无法通过协商达成一致，法院就会介入并进行判决。
法院在判决时，会从有利于子女身心健康、保障子女合法权益的角度出发，全面综合地考虑各种因素。
例如，父母双方的抚养能力，包括经济状况、收入水平等，经济状况更好的一方往往能为孩子提供更稳定的生活和优质的教育条件；再如，双方的抚养条件，像是否有更多的时间陪伴和照顾孩子，以及生活环境是否有利于孩子的成长等。
三、特殊情况
此外，若一方存在不利于孩子身心健康的情形，比如患有严重的传染性疾病、有虐待或者遗弃孩子的行为等，法院一般不会将抚养权判给该方。
因为这些情况可能会对孩子的成长造成严重的伤害。

案情回顾:

小朱和小李离婚时，就三周岁孩子的抚养权归属产生争议。小朱主张自己经济条件好，小李则称自己能更多陪伴孩子。双方协商无果后诉至法院，且小朱被指曾有轻微虐待孩子行为。

案情分析:

1、协商优先原则下，双方未能达成一致，所以无法通过协商确定抚养权归属。
2、综合考虑因素方面，小朱经济状况虽好，但小李有更多陪伴孩子的条件，双方各有优势。
3、特殊情况中，小朱存在轻微虐待孩子行为，这不利于孩子身心健康，法院一般不会将抚养权判给小朱。