当遭遇遗产被侵占的情况时，可参照以下处理办法来维护自身合法权益：
1.协商解决：
这是一种较为温和且高效的方式。
当发现遗产被侵占后，主动与侵占方展开友好的沟通。
在沟通时，清晰、明确地向对方指出其行为不符合法律和道德规范，详细说明该遗产依据法律或遗嘱等理应归属自己。
诚恳地要求对方归还侵占的遗产，并表明希望通过和平友好的方式解决问题，避免矛盾升级。
这种方式不仅能够节省大量的时间和精力，还能最大程度地避免双方陷入更为复杂和激烈的纠纷。
2.调解：
若协商未能达成一致，寻求第三方调解机构或相关组织的协助是个不错的选择，例如人民调解委员会。
这些机构和组织通常具有专业的调解人员，他们会在相对中立、公正的环境下，倾听双方的诉求和意见。
调解人员会依据法律和情理，对双方进行劝导和协调，促使双方重新审视问题，尽力达成和解。
3.诉讼解决：
若调解也无法解决问题，那么向法院提起诉讼是最后的保障。
在此之前，需要全面、细致地收集相关证据，如遗嘱原件、详细的财产清单、能够证明侵占行为的各种材料，如证人证言、相关文件记录等。
在诉讼过程中，法院会严格按照法律规定，依据所提供的证据来判定是否存在遗产侵占行为，并依法作出公正的判决。
总之，要结合具体情况，选择最为合适的处理方式。

案情回顾:

小朱的父亲去世后，留下一笔遗产。小胡却声称部分遗产应归自己，侵占了部分财产。小朱先与小胡协商，要求其归还，小胡却称自己有特殊理由不应归还，协商无果。后经调解，双方仍未达成一致。小朱决定诉讼维权，收集证据后向法院起诉。

案情分析:

1、协商阶段，小朱明确指出小胡行为不当，但小胡拒绝归还，导致协商无法解决问题，小胡的行为可能缺乏合法依据。
2、调解时，在中立环境下双方仍不能达成和解，说明双方争议较大。
3、小朱选择诉讼，只要其收集的证据能充分证明小胡侵占行为，法院会依据法律和证据作出公正判决，保障小朱合法权益。