关于遗产侵占超过20年的赔偿问题，需要依据不同情况来具体分析，以下为您详细阐述：
一、诉讼时效方面
在一般的民事权利纠纷中，诉讼时效期间规定为3年。
这意味着，从权利人清楚或者理应知道自身权利遭到损害，并且明确知道义务人是谁的时候开始计算。
然而，从权利实际受到损害之日起算，如果超过了20年，在没有特殊情况时，人民法院通常不会再对该案件进行保护。
特殊情况是指存在不可抗力等客观原因，使得权利人无法在规定时间内行使权利。
此时，人民法院会根据权利人的申请，综合各种因素来决定是否延长诉讼时效。
若超过20年且不存在特殊情况，那么权利人很可能就会丧失胜诉权。
二、赔偿数额方面
要是未超过诉讼时效，或者存在特殊情况使得法院受理了该案件，赔偿数额的确定通常会以被侵占遗产的实际价值作为基础。
同时，还需要充分考虑遗产在被侵占期间的增值、贬值情况。
例如遗产房产因侵占者的不当使用，像长期不维护导致房屋结构损坏，从而使房产价值贬损，这部分贬损的价值就应当计入赔偿范围。
此外，因侵占行为给合法继承人造成的其他直接或间接损失，如因无法及时获得遗产资金而错过投资机会产生的损失等，也应在赔偿数额的考量范围内。

案情回顾:

小朱的父亲去世后留下一笔遗产，被小李侵占。小朱20多年后才知晓此事，小朱要求小李赔偿，小李以超过20年为由拒绝。双方就遗产侵占超过20年是否应赔偿产生争议，且对赔偿数额也存在分歧。

案情分析:

1、从诉讼时效看，一般民事权利纠纷诉讼时效为3年，从权利人知道权利受损害及义务人时起算。超过20年且无特殊情况，法院通常不再保护，小朱可能丧失胜诉权，除非存在不可抗力等特殊情况可申请延长时效。
2、若未超时效或有特殊情况法院受理，赔偿数额以被侵占遗产实际价值为基础，还要考虑遗产增值、贬值及给继承人造成的其他直接或间接损失。