继承公证书按遗嘱是否有效，需依据不同情况具体分析，以下为您详细阐述：
1.遗嘱合法有效且公证程序合规时：
遗嘱本身要符合法律规定的形式要件和实质要件。
就形式要件而言，以自书遗嘱为例，必须是遗嘱人亲自书写全部内容，且要亲笔签名，并清晰注明书写日期。
实质要件则要求遗嘱人的意思表示真实，不存在受欺诈、胁迫等情形。
同时，公证机构在公证过程中，会严格按照法定程序，全面审查遗嘱的真实性与合法性。
例如，会核实遗嘱人的身份、行为能力等，在确认无误后才会出具继承公证书。
在这种情况下，继承公证书按遗嘱是有效的，能够保障遗嘱的顺利执行，维护继承人的合法权益。
2.遗嘱存在瑕疵或公证程序违法时：
若遗嘱存在形式上的缺陷，像代书遗嘱没有两个以上符合条件的见证人在场见证并签名，就可能影响其效力。
另外，公证过程中若出现违反公证程序的情形，比如公证员未对相关事实进行尽职审查，遗漏重要信息或者未核实关键内容，那么该继承公证书按遗嘱可能会被认定为无效。
总之，判断继承公证书按遗嘱的有效性，需要综合考量遗嘱本身以及公证程序是否严格符合法律规定。

案情回顾:

小朱去世后留下一份自书遗嘱，指定小李为继承人。小李持该遗嘱申请继承公证书，公证机构审查后出具了公证书。但小胡提出异议，称遗嘱可能非小朱真实意思表示，且公证程序可能存在瑕疵。

案情分析:

1、若遗嘱合法有效且公证程序合规，如小朱自书遗嘱符合形式与实质要件，公证机构也严格审查了小朱身份、行为能力等，那么继承公证书按遗嘱有效，能保障小李顺利继承。
2、若遗嘱存在瑕疵或公证程序违法，比如遗嘱并非小朱真实意愿，或公证员未尽职审查，遗漏关键信息，那么该继承公证书按遗嘱可能会被认定为无效。