夫妻双方房产特殊约定通常是有效的，具体情况如下：
1.有效条件：
需是双方真实意思的表示。
也就是说，双方在做出约定时，应是在没有受到欺诈、胁迫等不正当影响的情况下，自愿、真实地表达自己的意愿。
不能违反法律、行政法规的强制性规定以及公序良俗。
例如，不能约定将房产用于非法活动等。
2.约定内容：
双方可约定某套房产仅归一方所有，像一方在婚前出资较多，婚后双方协商该房产归出资多的一方。
也可约定离婚时房产的分配方式，如按一定比例分割等。
3.约定形式：
这种约定最好通过书面形式明确，比如签订婚内财产协议，明确写明房产的相关约定内容。
4.特殊情况：
若房产属夫妻共同财产，仅一方进行约定有风险。
若对方事后否认，主张约定无效，可能需通过法律途径确认效力。
只要符合法定条件，夫妻双方房产特殊约定就具有法律效力。

案情回顾:

小朱和小丽是夫妻，婚后购买一套房产。小朱婚前出资较多，双方口头约定该房产归小朱所有。后因感情破裂准备离婚，小丽否认此前约定，主张房产应按夫妻共同财产分割，双方就此产生争议。

案情分析:

1、小朱和小丽最初的口头约定虽体现一定意愿，但未采用书面形式，不符合约定形式中最好以书面形式明确的要求，存在瑕疵。
2、小丽事后否认约定，由于缺乏书面协议佐证，小朱难以充分证明该约定是双方真实意思表示，若要确认约定效力，可能需通过法律途径解决。
3、双方最初约定未违反法律、行政法规强制性规定及公序良俗，若能证实是真实意思表示，本应有效，但因形式问题引发争议。