关于贷款房子婚内财产协议在离婚时是否有效，需根据具体情况判断，以下为您详细分析：
一、协议内容合法合规时有效
婚内财产协议若要在离婚时对贷款房子的约定有效，首先需是双方完全自愿签订的。
这意味着双方在签订协议时，没有受到任何外界的强迫、威胁或诱导，是基于自身真实的想法和意愿来达成这份协议。
同时，协议要对贷款房屋的归属以及剩余贷款的偿还等关键事项作出清晰、明确且合法的约定。
例如，明确约定房屋归其中一方所有，而获得房屋所有权的这一方需负责偿还剩余的贷款。
并且，该协议不能违反法律法规的强制性规定，也不能违背公序良俗。
比如，不能约定将房屋归属给不具备相关权益的第三人等。
在满足这些条件的情况下，这份协议在离婚时通常是有效的。
二、存在法定无效情形时无效
若婚内财产协议存在法定无效的事由，那么其关于贷款房子的约定在离婚时可能就不被认可。
比如，协议签订过程中存在欺诈、胁迫等不正当手段。
例如，一方在签订协议时故意隐瞒了房屋存在重大质量问题等重要事实，从而误导对方作出了错误的意思表示。
或者协议损害了国家、集体或第三人的利益，像为了逃避债务而恶意约定房屋归属等情况，这样的协议都会被认定为无效。
综上所述，只要婚内财产协议符合法律规定且体现双方真实意愿，关于贷款房子的约定在离婚时一般是有效的。

案情回顾:

小朱和小李婚内签订财产协议，对贷款房子的归属和剩余贷款偿还作了约定。离婚时，小朱认为协议有效，房子应按协议归自己且自己偿还贷款；小李则称签订时受胁迫且协议损害第三人利益，应无效，双方就此产生争议。

案情分析:

1、若协议是双方完全自愿签订，不存在强迫、威胁或诱导，且对房屋归属、贷款偿还等关键事项约定清晰合法，不违反法律法规和公序良俗，如无将房屋给无关第三人等情况，协议通常有效。
2、若签订中存在欺诈、胁迫，如一方隐瞒房屋重大问题误导对方，或者损害国家、集体、第三人利益，像为逃债恶意约定房屋归属，协议则无效。