若配偶患有精神疾病，离婚时该夫妻共有的房屋将依据当事人之间达成的协议来进行分配。倘若无法达成一致意见，届时可由当地的民事法庭依照财产的实际状况，并顾及到子女、女方以及无过错方的权益，做出最终的决断。
然而当协议仍然无法被达成时，民事法庭会综合考虑各种因素，以确保子女与女方的利益得到最大程度的保护，进而做出最后的裁定。
值得注意的是，如果该房屋是男方独立购买所得，那么在认定离婚时，此房产应视为男方私人财产，而不纳入其范围内进行分割，仍然是男方的专享财产。在处理此类司法事务时，由于精神病人具有特殊性，裁判者通常会予以更大的关照，使得他们在权益方面能够获得更宽裕的保障，获得相对较多的份额。

《民法典》第一千零八十七条
离婚时，夫妻的共同财产由双方协议处理；
协议不成的，由人民法院根据财产的具体情况，按照照顾子女、女方和无过错方权益的原则判决。对夫
或者妻在家庭土地承包经营中享有的权益等，应当依法予以保护。