结婚证丢失后依然可以办理离婚，主要有以下两种途径：
补办结婚证后再进行离婚。
夫妻双方需携带户口簿、身份证等相关证件，前往原办理婚姻登记的机关或者一方当事人常住户口所在地的婚姻登记机关申请补领结婚证。
婚姻登记机关会对婚姻登记档案进行仔细查证，确保信息真实无误后，为其补发结婚证。
拿到补发的结婚证后，便可按照正常的离婚程序，如双方协商一致签订离婚协议，然后共同到婚姻登记机关办理离婚登记；若协商不成，一方可向法院提起离婚诉讼。
直接提起诉讼离婚。
这种情况下，当事人可以直接向法院提起离婚诉讼，法院会依据结婚登记档案或其他相关证据来认定婚姻关系的存在。
然而，在诉讼过程中，可能会遇到一些关于证据的问题，比如在财产分割方面，可能需要提供关于财产的相关凭证、合同等；在子女抚养问题上，可能需要提供子女的出生证明、抚养能力证明等其他证据来加以佐证。
总之，结婚证的丢失并不会对离婚造成实质性的阻碍，只需根据自身的具体情况，谨慎选择合适的离婚方式即可。

案情回顾:

小朱和小李夫妻二人结婚证丢失。小朱想离婚，他提出两种方案，一是补办结婚证后再离，二是直接诉讼离婚，但小李不同意补办结婚证。小朱认为直接诉讼离婚证据不好收集，而小李觉得补办结婚证麻烦。双方僵持不下。

案情分析:

1、如果小朱选择补办结婚证后离婚，按规定夫妻双方带证件到相应机关申请补领，查证无误补发后可按正常程序离婚。
2、若小朱选择直接诉讼离婚，法院会依据结婚登记档案等认定婚姻关系，但在财产分割、子女抚养方面需更多证据，这对小朱的诉求有一定挑战。