在商品房购买协议中若未能就违约金金额或损失赔偿额的计算方式作出明确规定，那么违约金金额或损失赔偿额则应依据以下相关准则进行推算：
首先是逾期交房的违约金估算标准：应以逾期交付使用期内相应主管部门所发布的信息为准，同时参考具备资质且符合要求的房地产估价机构针对同区域、同等房屋类型的租金评估结果进行确定；
其次是逾期付款的违约金计算法则：具体而言，即根据未支付的购房款项总额为依据，参考中国人民银行相关规定，通过金融机构逾期计息标准来计算；
最后是逾期办理房产所有权登记手续的违约金设定：该项违约金金额的制定同样依赖于已支付的房款总额，并参照中国人民银行关于金融机构逾期计息标准的相关规定进行计算。

《民法典》第五百八十五条
当事人可以约定一方违约时应当根据违约情况向对方支付一定数额的违约金，也可以约定因违约产生的损失赔偿额的计算方法。