在处理合同纠纷时，我们可采用如下几种方式来妥善化解矛盾与疑虑：首先是本着友好沟通协商的原则去解决问题；其次可以选择让第三方调解人员参与其中，推动双方达成共识；第三种方式就是申请仲裁。如果各方都不愿意或无法通过协商和调解途径进行和解，那么各方可根据之前签订的合伙协议中的仲裁条款或是之后以书面形式形成的仲裁协议，聘请相关的仲裁机构进行仲裁。另一方面，如果合伙协议并没有明确规定仲裁条款，且在后续过程中也未能达成书面形式的仲裁协议，那么就只能寻求公平公正的司法审判途径了。

《民法典》第二百三十三条
物权受到侵害的，权利人可以通过和解、调解、仲裁、诉讼等途径解决。