如果遇到鉴定不合格的房屋，可参考以下处理方式：
一、确认鉴定报告效力
在处理鉴定不合格房屋问题时，首先要重视鉴定报告的效力。
必须确保房屋鉴定是由具备相应资质的专业机构来进行的，这些机构需要有相关部门颁发的合法资质证书，其专业人员也应具备相应的从业资格。
而且鉴定过程要严格按照法定程序开展，从现场勘查、数据采集到分析评估等各个环节，都需符合相关规定。
只有这样，出具的鉴定报告才具有法律效力，能为后续处理提供可靠依据。
二、与相关责任方协商
1.若房屋还在保修期内，购房者可依据《商品房销售管理办法》，要求开发商承担修复、赔偿等责任。
开发商交付的房屋本就应符合质量标准，所以对于鉴定出的问题，他们有义务进行整改，让房屋达到合格标准，并对给购房者造成的损失进行赔偿。
2.若是二手房等其他情况，就需根据导致房屋不合格的具体原因，找对应的责任方协商解决。
三、申请行政干预或司法救济
1.若与责任方协商不成，购房者可向当地住建等相关部门反映情况，请求行政介入。
相关部门会根据具体情况进行调查和处理。
2.购房者也可以收集相关证据，如鉴定报告、购房合同、沟通记录等，向法院提起民事诉讼，要求责任方承担相应的法律责任，如赔偿损失、修复房屋等，以此维护自身合法权益。

案情回顾:

小朱购买了一套房屋，后经鉴定为不合格房屋。争议点在于鉴定报告的效力以及责任承担问题。小朱认为鉴定机构有资质且程序合法，要求开发商承担责任，开发商则质疑鉴定报告效力，拒绝担责，双方协商无果。

案情分析:

1、关于鉴定报告效力，需审查鉴定机构是否具备相应资质、专业人员是否有从业资格以及鉴定过程是否按法定程序开展。若均符合要求，则报告具有法律效力。
2、因房屋在保修期内，按规定开发商应承担修复、赔偿等责任。若协商不成，小朱可申请行政干预或收集证据向法院提起民事诉讼，要求开发商承担法律责任。